進口微波消解儀工作的過程是組織內的極性分子在微波場的作用下高速運動磨擦產生熱量，當溫度升高到60℃以上時，細胞的蛋白質變性凝固，導致其不可逆性壞死。滅活的組織可生產熱休克蛋白，刺激機體的免疫系統，提高機體的免疫功能，起到抑制細胞擴散的作用，具有熱效率高，升溫速度快，熱場均勻等優點。極性分子的物質會吸收微波(屬損耗因子大的物質)，如：水、酸等。它們的分子具有*偶極矩，即分子的正負電荷的中心不重合。極性分子在微波場中隨著微波的頻率而快速變換取向，來回轉動，使分子間相互碰撞摩擦，吸收了微波的能量而使溫度升高。
當微波通過試樣時，極性分子隨微波頻率快速變換取向，2450MHz的微波，分子每秒鐘變換方向2.45×109次，分子來回轉動，與周圍分子相互碰撞摩擦，分子的總能量增加，使試樣溫度急劇上升。同時試液中的帶電粒子(離子、水合離子等)在交變的電磁場中，受電場力的作用而來回遷移運動，也會與臨近分子撞擊，使得試樣溫度升高。進口微波消解儀的這種加熱方式與傳統的電爐加熱方式絕然不同。熱是由外向內通過器壁傳導給試樣，在器壁表面上很容易形成氣泡，因此就不容易出現過熱現象，溫度保持在沸點上，因為氣化要吸收 的熱。而在微波場中，能量在體系內部直接轉化。
